Таина Федосеева
29 мая 2021

У всех городов есть уникальный микробный «отпечаток пальца». Исследование

В 2015 году генетик Крис Мейсон из Weill Cornell Medicine увидел, как его дочь лизнула шест в метро Нью-Йорка и решил узнать, что за микробный обмен только что произошел.

Когда он опубликовал свое исследование, обнаружив множество ранее неизвестных видов микробов в городской подземке, с ним связались другие исследователи для проведения куда более масштабного эксперимента. Мейсон и его коллеги брали образцы из метро, автобусов, поездов и трамваев в шестидесяти городах мира, от Балтимора до Боготы в Колумбии и до Сеула в Южной Корее. Они идентифицировали тысячи новых вирусов и бактерий и обнаружили, что каждый город имеет уникальный микробный «отпечаток пальца».

Фото — Wired

Фото — Wired

Исследование «фантастическое», — говорит Адам Робертс, микробиолог из Ливерпульской школы тропической медицины, который не принимал участия в исследовании. По его словам, хотя ранее изучались отдельные города или транспортные системы, новый проект дал куда больше информации.

Чтобы собрать образцы, ученые протирали обычные поверхности транспортных систем — скамейки, турникеты и билетные киоски, причем указывается, что делали они это около трех минут: достаточно, чтобы получить ДНК и в то же время не привлечь внимание людей странными действиями.

Вернувшись в лабораторию, исследователи проанализировали ДНК. Они обнаружили, что около 45% не соответствуют ни одному из известных видов: около 11000 вирусов и 1302 бактерии были новыми для науки.

В 97% образцов присутствовал набор из 31 вида организмов — они сформировали то, что ученые назвали ядром городского микробиома. Еще 1145 видов присутствовали в более чем 70% проб.

Но исследователи также обнаружили менее распространенные виды. Они дали каждому городу уникальный микробиом, который может предсказать с точностью 88%, из какого города были взяты случайные образцы.

Комментарии